Отдел образован в 2012 году. Основной задачей Отдела является осуществление взаимодействия с Вооруженными Силами, правоохранительными учреждениями и ведомствами Российской Федерации, имеющими в своем составе воинские формирования, координация и практическое осуществление пастырской и духовно - просветительской деятельности среди военнослужащих, сотрудников правоохранительных учреждений, членов их семей.
В 2012 году назначен председателем вновь образованного отдела по взаимодействию с вооруженными силами и силовыми ведомствами иерей Александри Белков (ныне епископ Алатырский и Порецкий Феодор).
С 5 декабря 2012 г.по 2013г. иерей Владимир Дормидонтов.
С 2014 по июнь 2022г. председателем отдела был протоиерей Сергий Барашков.